Odbory sú základnými organizačnými stupňami riadenia a rozhodovania. Sú nositeľmi úloh SFK podľa vymedzených okruhov činnosti. Na čele je vedúci odboru.Odbory sa členia na oddelenia, ktoré zabezpečujú výkon odborných činností. Na čele oddelenia je vedúci oddelenia priamo podriadený vedúcemu odboru.
Na výkon kontroly sa v rámci oddelení odboru finančnej kontroly vytvárajú kontrolné skupiny. Veľkosť kontrolných skupín je závislá na rozsahu obsahovej a časovej náročnosti konkrétnej kontrolnej akcie s možnosťou využitia aj prizvaných osôb v zmysle § 15 ods. 1 zák. NR SR č. 10/1996 Z. z. o kontrole v štátnej správe alebo § 24 zákona NR SR č. 502/2001 Z.z. o finančnej kontrole a vnútornom audite v znení neskorších predpisov.
Vedúci ekonomicko – správneho odboru je zároveň vedúcim osobného úradu. Osobný úrad zabezpečuje plnenie úloh, vyplývajúcich zo štátnozamestnaneckých vzťahov podľa zákona o štátnej službe. Súčasne zabezpečuje aj uplatňovanie právnych vzťahov zamestnancov SFK Zvolen pri výkone práce vo verejnom záujme podľa zákona o výkone práce vo verejnom záujme.